正在阅读:全球第二的超算分析新冠 却给出这样的答案全球第二的超算分析新冠 却给出这样的答案

2020-09-04 00:15 出处:PConline原创 作者:佚名 责任编辑:songshipeng

  [PConline 资讯]如果说起超级计算机这种国家战略型设备,那么在这个话题上仅今年无论如何也绕不开在美国橡树岭实验室的Summit超级计算机,这款打破自2013年中国在全球超算霸主地位的超级计算机,虽然在2020年最新TOP500中已屈于亚军,但作为迈向E级超算的标杆,其性能和运算能力却备受世界瞩目。

  自新冠疫情爆发以来,不少世界强国纷纷拿出自家超级计算机推演疫情变化,通过近期公布的信息来看,全球第二的Summit 超算分析了来自 1.7 万个基因样本的 4 万多个基因数据,此举旨在加深对新冠病毒的理解。Summit用了一周多时间处理了这些数据。研究人员对结果进行了分析,揭示了新冠病毒如何影响人体的新理论——缓激肽假说(bradykinin hypothesis)。

  假说提供了一个模型解释新冠病毒的很多方面,包括最奇特的症状。它还提出了十多种潜在疗法,其中部分已经被 FDA 批准。研究发现发表在《eLife》期刊上。根据这一研究发现,新冠病毒的感染通常是从鼻部的 ACE2 受体进入人体的,然后在人体内进入其它存在大量 ACE2 受体的组织如肠道、肾脏和心脏。这能部分解释新冠的心脏和胃肠道症状。一旦新冠病毒在人体内取得立足之地,事情开始变得有意思了。Summit 分析的数据显示,新冠病毒不再满足于简单感染已表达大量 ACE2 受体的细胞,它开始主动劫持人体自身系统,欺骗它去上调 ACE2 受体表达较低水平或中等水平的组织,如肺部。肾素血管紧张素系统(RAS)控制着循环系统的众多方面,包括名叫缓激肽的化合物水平。缓激肽有助于调节血压。当新冠病毒微调 RAS 系统时,会导致调节缓激肽的机制出现混乱。缓激肽受体再次致敏,而人体也停止有效分解缓激肽。研究人员称,最终结果是释放缓激肽风暴——缓激肽在人体内失控积累。根据缓激肽假说,正是它导致了许多致命结果。FDA 已经批准了多种针对  RAS 系统的药物,它们可疑减少缓激肽的产生,阻止致命的缓激肽风暴。研究人员还指出,维生素 D 可能是一种潜在的治疗药物,有助于阻止缓激肽风暴的形成。

  Summit超级计算机采用IBM Power9微处理器和NVIDIA Volta GPU进行数学协同处理。Summit的前身Titan超级计算机,拥有超过18000个节点,而Summit将有约3400个节点。每个节点将拥有至少500GB相干内存,以及800GB非易失性内存。Summit超级计算机原定计算性能是150petaflops,交付性能达到200petaflops,IBM这款超级计算机交易据说价值3.25亿美元。

 
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